A aprendizagem baseada em projetos é uma marca do Planeta Mágico Alfa CEM e tem como objetivo a aplicação e aprofundamento dos conteúdos trabalhados em sala de aula, em várias áreas do conhecimento, colocando o aluno como agente do processo de construção do saber. Trabalhos em times, interdisciplinaridade e o protagonismo dos estudantes são garantias pedagógicas provenientes dessa metodologia ativa.